قصة فيلم المحقق كونان 24: الرصاصة القرمزية تدور بمجرّد إطلاق مشروع قطار الرّصاصة القرمزيّة يسعى المحقّق كونان لكشف ملابسات حوادث الخطف هذه التي يجمعها لغز واحد حيَّر الجميع.